[[Lêer:Martinus Theunis Steyn, Vanity Fair, 1900-08-09.jpg|thumbduimnael|links|220px|Karikatuur van M.T. Steyn met die onderskif: "ex President Steyn".]]
Met die uitbreek van die [[Anglo-Boere-oorlogTweede Vryheidsoorlog]] in 1899 het Steyn geen keuse gehad om die ZAR se oorlogsverklaring teen Brittanje te steun nie. As hoof van 'n regering moes hy vlug nadat Bloemfontein deur die Britse troepe oorgeneem is, maar het steeds as reisende regering die oorlog teen die Britte aan die gang gehou. Hy was versetlik gekant teen oorgawe aan Brittanje. Hy is landuit nanadat die [[Vrede van Vereeniging]] onderteken is, maar keer in 1904 terug na Suid-Afrika, om weer toe te tree tot die aktiewe politiek.
